MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV38

Total Repeats: 819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007506	CAG	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007506	GCA	2	6	164	169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007506	GACC	2	8	188	195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007506	GCC	2	6	266	271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007506	C	7	7	270	276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NC_007506	ACT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007506	AGC	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007506	CAAT	2	8	375	382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007506	CCGC	2	8	432	439	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_007506	TGC	2	6	475	480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007506	GT	3	6	495	500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007506	GCA	2	6	632	637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007506	CGC	2	6	646	651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007506	CAA	2	6	692	697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007506	GGC	2	6	727	732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007506	CAC	2	6	764	769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007506	A	6	6	886	891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007506	GC	3	6	902	907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007506	CCG	2	6	917	922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007506	GCCAG	5	25	941	965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007506	G	6	6	992	997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007506	CTG	2	6	1003	1008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007506	GCT	2	6	1030	1035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007506	CGAAAA	2	12	1055	1066	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007506	A	6	6	1063	1068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007506	GGC	2	6	1082	1087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007506	TCA	2	6	1092	1097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007506	CCG	2	6	1155	1160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007506	ACC	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007506	CAG	2	6	1246	1251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045266
31	NC_007506	ACCG	2	8	1283	1290	25 %	0 %	25 %	50 %	78045266
32	NC_007506	AAG	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045266
33	NC_007506	GCCG	2	8	1357	1364	0 %	0 %	50 %	50 %	78045266
34	NC_007506	GC	3	6	1397	1402	0 %	0 %	50 %	50 %	78045266
35	NC_007506	GAA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045266
36	NC_007506	GTT	2	6	1520	1525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045266
37	NC_007506	GCT	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045266
38	NC_007506	GCG	2	6	1594	1599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045266
39	NC_007506	AGC	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045266
40	NC_007506	GC	3	6	1673	1678	0 %	0 %	50 %	50 %	78045266
41	NC_007506	GCTC	2	8	1684	1691	0 %	25 %	25 %	50 %	78045266
42	NC_007506	ATG	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045266
43	NC_007506	CCA	2	6	1723	1728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045266
44	NC_007506	GCG	2	6	1736	1741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045266
45	NC_007506	GGC	2	6	1761	1766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045266
46	NC_007506	GGCG	2	8	1784	1791	0 %	0 %	75 %	25 %	78045266
47	NC_007506	TGG	2	6	1825	1830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045266
48	NC_007506	CAC	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045266
49	NC_007506	GCG	2	6	1974	1979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045266
50	NC_007506	CGC	2	6	2077	2082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007506	GTG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007506	CAG	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007506	CAG	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007506	CGC	3	9	2330	2338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007506	AAACC	2	10	2418	2427	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007506	GCG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007506	CCT	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007506	CAA	2	6	2468	2473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007506	CAG	2	6	2479	2484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007506	GGT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007506	CCG	2	6	2648	2653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007506	CAG	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045267
63	NC_007506	TCA	2	6	2781	2786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045267
64	NC_007506	GGC	2	6	2791	2796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045267
65	NC_007506	CCA	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045267
66	NC_007506	GC	4	8	2860	2867	0 %	0 %	50 %	50 %	78045267
67	NC_007506	GGTTC	2	10	2881	2890	0 %	40 %	40 %	20 %	78045267
68	NC_007506	ACG	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045267
69	NC_007506	GT	3	6	3171	3176	0 %	50 %	50 %	0 %	78045268
70	NC_007506	GC	3	6	3212	3217	0 %	0 %	50 %	50 %	78045268
71	NC_007506	TGA	2	6	3256	3261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045268
72	NC_007506	ATG	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007506	GTAT	2	8	3498	3505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007506	CAGC	2	8	3617	3624	25 %	0 %	25 %	50 %	78045269
75	NC_007506	T	6	6	3644	3649	0 %	100 %	0 %	0 %	78045269
76	NC_007506	GCGCT	2	10	3669	3678	0 %	20 %	40 %	40 %	78045269
77	NC_007506	GCGG	2	8	3688	3695	0 %	0 %	75 %	25 %	78045269
78	NC_007506	GGC	2	6	3699	3704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045269
79	NC_007506	GTGGC	2	10	3707	3716	0 %	20 %	60 %	20 %	78045269
80	NC_007506	GGC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045269
81	NC_007506	CCT	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045270
82	NC_007506	GAA	2	6	3851	3856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045270
83	NC_007506	GGC	2	6	3875	3880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045270
84	NC_007506	ACCG	2	8	4133	4140	25 %	0 %	25 %	50 %	78045270
85	NC_007506	CAG	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045270
86	NC_007506	ACG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045270
87	NC_007506	TTGC	2	8	4238	4245	0 %	50 %	25 %	25 %	78045270
88	NC_007506	GGT	3	9	4277	4285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045270
89	NC_007506	ACG	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045270
90	NC_007506	TGC	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045270
91	NC_007506	CAG	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045270
92	NC_007506	CGG	2	6	4405	4410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045270
93	NC_007506	CGC	2	6	4426	4431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045270
94	NC_007506	AC	3	6	4443	4448	50 %	0 %	0 %	50 %	78045270
95	NC_007506	CTAT	2	8	4468	4475	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007506	TA	3	6	4477	4482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007506	GCAGC	2	10	4494	4503	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_007506	TA	5	10	4554	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007506	CCTA	2	8	4564	4571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007506	GCA	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007506	CCG	2	6	4648	4653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_007506	GAT	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045271
103	NC_007506	CTC	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045271
104	NC_007506	CAG	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045271
105	NC_007506	GCC	2	6	4752	4757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045271
106	NC_007506	T	6	6	4773	4778	0 %	100 %	0 %	0 %	78045271
107	NC_007506	CTG	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045271
108	NC_007506	CCG	2	6	4804	4809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045271
109	NC_007506	ACCCCC	2	12	4810	4821	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	78045271
110	NC_007506	CCG	2	6	4831	4836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045271
111	NC_007506	GTT	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045271
112	NC_007506	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78045271
113	NC_007506	TAT	3	9	4899	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78045271
114	NC_007506	CAAA	2	8	4911	4918	75 %	0 %	0 %	25 %	78045271
115	NC_007506	GGC	2	6	5039	5044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045272
116	NC_007506	ACG	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
117	NC_007506	GGC	2	6	5086	5091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045272
118	NC_007506	CAG	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
119	NC_007506	TGG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045272
120	NC_007506	CAG	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
121	NC_007506	GCC	2	6	5178	5183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
122	NC_007506	CGC	2	6	5189	5194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
123	NC_007506	GCC	2	6	5211	5216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
124	NC_007506	GGCT	2	8	5219	5226	0 %	25 %	50 %	25 %	78045272
125	NC_007506	CAG	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
126	NC_007506	GCA	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
127	NC_007506	GCC	2	6	5367	5372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
128	NC_007506	TGG	2	6	5407	5412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78045272
129	NC_007506	CAG	2	6	5418	5423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
130	NC_007506	CGC	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
131	NC_007506	AGC	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045272
132	NC_007506	CGC	2	6	5531	5536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
133	NC_007506	CGCC	2	8	5581	5588	0 %	0 %	25 %	75 %	78045272
134	NC_007506	GCC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045272
135	NC_007506	GCCGC	2	10	5622	5631	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_007506	ATC	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007506	TTTG	2	8	5677	5684	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007506	AAAC	2	8	5742	5749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007506	ACC	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045273
140	NC_007506	GC	3	6	5806	5811	0 %	0 %	50 %	50 %	78045273
141	NC_007506	GC	3	6	5864	5869	0 %	0 %	50 %	50 %	78045273
142	NC_007506	ACT	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045273
143	NC_007506	CCGAG	2	10	5929	5938	20 %	0 %	40 %	40 %	78045273
144	NC_007506	GCCG	2	8	5961	5968	0 %	0 %	50 %	50 %	78045273
145	NC_007506	CGA	2	6	6087	6092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045273
146	NC_007506	GCA	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045273
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148	NC_007506	GCC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045273
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152	NC_007506	GCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045273
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161	NC_007506	GGC	2	6	6728	6733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045273
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163	NC_007506	TAG	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_007506	AGC	2	6	7058	7063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_007506	CAGG	2	8	7113	7120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_007506	CA	3	6	7158	7163	50 %	0 %	0 %	50 %	78045274
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259	NC_007506	CTG	2	6	11435	11440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045279
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262	NC_007506	CGT	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_007506	GGT	2	6	11785	11790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_007506	GAA	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_007506	GGA	2	6	11964	11969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045280
266	NC_007506	TC	3	6	12043	12048	0 %	50 %	0 %	50 %	78045280
267	NC_007506	CCGA	2	8	12098	12105	25 %	0 %	25 %	50 %	78045280
268	NC_007506	GC	3	6	12152	12157	0 %	0 %	50 %	50 %	78045280
269	NC_007506	TGC	2	6	12173	12178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045280
270	NC_007506	AAG	2	6	12193	12198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045280
271	NC_007506	GCCG	2	8	12252	12259	0 %	0 %	50 %	50 %	78045280
272	NC_007506	GCC	2	6	12268	12273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045280
273	NC_007506	GGA	2	6	12312	12317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78045280
274	NC_007506	AGG	2	6	12335	12340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
275	NC_007506	TA	3	6	12361	12366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_007506	CAG	2	6	12374	12379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_007506	AGG	2	6	12386	12391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
278	NC_007506	GCC	2	6	12464	12469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045281
279	NC_007506	CGG	2	6	12483	12488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045281
280	NC_007506	CCG	2	6	12526	12531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045281
281	NC_007506	ACG	2	6	12549	12554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045281
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284	NC_007506	CG	3	6	12643	12648	0 %	0 %	50 %	50 %	78045281
285	NC_007506	CGC	2	6	12665	12670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78045281
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288	NC_007506	GATG	2	8	12777	12784	25 %	25 %	50 %	0 %	78045282
289	NC_007506	TGA	2	6	12929	12934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045282
290	NC_007506	CA	3	6	12943	12948	50 %	0 %	0 %	50 %	78045282
291	NC_007506	GC	3	6	12949	12954	0 %	0 %	50 %	50 %	78045282
292	NC_007506	GAC	2	6	12973	12978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045282
293	NC_007506	GCG	2	6	13022	13027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_007506	GTT	2	6	13099	13104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045283
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297	NC_007506	CAC	2	6	13243	13248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78045283
298	NC_007506	GCA	2	6	13293	13298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045283
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302	NC_007506	GCT	2	6	13555	13560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045283
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312	NC_007506	AGA	2	6	13926	13931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045284
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402	NC_007506	CGA	2	6	18699	18704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045287
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406	NC_007506	GCCG	2	8	18889	18896	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
407	NC_007506	CG	3	6	18901	18906	0 %	0 %	50 %	50 %	78045287
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